在闵行经济开发区注册工程公司后，首要考虑的是法律合规问题。公司必须遵守中国的相关法律法规，包括建筑领域的规定以及劳动法、税法等。特别是在工程建设领域，各项工程必须符合国家和地方的建设标准，否则可能会导致项目延期、罚款甚至责任追究。
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此外，工程公司还需要关注环境保护法律法规，尤其是在建设项目中对环境的影响要进行评估和管理。另外，知识产权的保护也是一项重要的法律问题，尤其是在技术创新和专利申请方面。
为了确保法律合规，工程公司需要建立健全的法律顾问团队，及时了解最新法规的变化，并制定相应的内部管理制度和流程。
财务管理是工程公司内部管理的关键之一。公司需要建立完善的财务制度，包括预算管理、成本控制、资金运作等方面。特别是在工程项目的招投标过程中，财务数据的真实性和透明度至关重要，关系到项目的竞争力和信誉。
此外，工程公司还需要注重税务管理，合理规避税收风险，确保税收合规。另外，对于与客户的合同管理也是财务管理的重要内容，需要建立有效的合同管理制度，确保合同的执行和收款。
维护财务稳定和健康发展，工程公司需要建立财务团队，加强内部审计和风险控制，提高财务管理水平。
人力资源是工程公司的核心资源，而人力资源管理直接影响到公司的竞争力和可持续发展。工程公司需要建立科学的人力资源管理制度，包括招聘、培训、绩效考核、激励机制等。
在人才招聘方面，工程公司需要根据项目需求和发展战略，吸引和留住优秀人才。在员工培训方面，公司需要不断提升员工的专业技能和管理能力，以适应市场竞争的变化。
另外，工程公司还需要建立良好的员工关系，保障员工的权益，提高员工的归属感和凝聚力。在解决劳动纠纷和员工福利方面，公司需要建立有效的沟通机制和处理流程。
项目管理是工程公司的核心业务，直接影响到项目的质量、进度和成本。公司需要建立科学的项目管理体系，包括项目立项、计划编制、进度跟踪、质量控制、安全管理等。
在项目立项阶段，工程公司需要对项目进行全面评估，确定项目的可行性和风险，制定详细的项目计划和实施方案。在项目实施阶段，公司需要加强对项目进度和成本的监控，及时调整项目资源，确保项目顺利进行。
另外，工程公司还需要注重项目质量和安全管理，建立健全的质量管理体系和安全管理制度，提高项目的执行能力和风险防范能力。
综上所述，注册工程公司后，需要综合考虑法律合规、财务管理、人力资源管理和项目管理等内部管理机制问题。只有建立健全的内部管理机制，才能确保公司的稳健发展和长期竞争力。